La Guerra de la Convención generada por la Francia revolucionaria en toda Europa llegó también a España y afectó principalmente a ambos extremos de los Pirineos. Gipuzkoa levantó su gente, según su fuero y se preparó para la guerra desde 1792, pero sus milicias y sus medios no eran adecuados para una guerra de fin del siglo XVIII. Por su parte el ejército español estaba bien dotado a comienzos de 1793 pero fue superado en 1794 y 95 por un ejército francés con más medios humanos y materiales. Algunos guipuzcoanos, como fue el caso del Diputado General Don José Fernando de Echave y Asu y Romero y la Diputación que controlaba, apoyaron a los convencionales esperando convertir a la Provincia en una República independiente bajo tutela francesa, o anexionarla a la Francia revolucionaria. No obstante, la mayoría de la Provincia, con sus Juntas provinciales, se mantuvo fiel al Rey y logró resistir prácticamente hasta la firma de la Paz de Basilea de 1795. La sentencia del Consejo de Guerra y el perdón a los colaboracionistas civiles que siguieron a la contienda fueron, cuando menos, contradictorios e inexplicables.
